农村土地纠纷是当前基层社会治理中的常见问题，涉及农民切身利益与农村稳定。当纠纷发生时，当事人首先面临的核心困惑往往是：应当向哪个部门寻求解决？我国法律与实践已构建起多层次、多渠道的纠纷解决机制，当事人可根据纠纷性质与具体情况，选择相应途径。
首要的途径是请求村民委员会或乡镇人民政府进行调解。根据《中华人民共和国土地管理法》等相关规定，农村集体土地所有权和使用权争议，当事人可先申请由乡级或县级以上人民政府处理。村委会作为基层群众性自治组织，熟悉本地情况，常能有效调解因土地承包、流转、边界不清引发的邻里矛盾。乡镇政府则具有行政调解职能，可对涉及土地承包合同、征地补偿等纠纷进行协调。此途径强调协商与调解，有利于维系乡土人情，是解决轻微纠纷的首选。
若行政调解未果或纠纷涉及权属确认，则需申请行政机关作出具体行政处理。对于土地所有权或使用权的权属争议，当事人应当依法向县级以上人民政府自然资源主管部门（即自然资源局）提出确权申请。该部门经调查核实后，可作出行政决定，明确土地权属。例如，对宅基地、集体建设用地权属的争议，即属此列。若当事人对政府处理决定不服，可在法定期限内提起行政复议或行政诉讼，通过法律程序审查行政行为的合法性。
司法诉讼是解决土地纠纷的最终法律保障。当事人亦可选择直接向人民法院提起诉讼，或在对行政处理决定不服后提起诉讼。法院受理的农村土地纠纷案件类型广泛，包括土地承包合同纠纷、侵权纠纷、征地补偿费用分配纠纷等。司法裁判具有权威性和强制执行力，能够为当事人提供终局性的权利救济。尤其对于复杂的合同纠纷或侵权赔偿争议，诉讼程序能更严格地依据法律认定事实与划分责任。
仲裁作为一项准司法途径，在某些特定纠纷中适用。例如，因农村土地承包经营发生的纠纷，当事人可以向农村土地承包仲裁委员会申请仲裁。仲裁程序相对灵活、快捷，裁决一经作出亦具法律约束力。
解决农村土地纠纷的部门并非单一，而是形成了一个由基层调解组织、行政机关、仲裁机构与司法机关共同构成的多元化解网络。当事人在寻求解决时，应首先厘清纠纷的法律性质——是权属争议、合同违约还是侵权损害，进而选择对应的调解、行政处理或司法诉讼渠道。倡导遵循“调解优先、行政介入、司法终局”的原则，理性、合法地维护自身权益，方能有效化解矛盾，促进农村社会的和谐与稳定。